1. 基本属性

• 靶基因：FNDC1（Fibronectin Domain Containing 1），编码含Ⅲ型纤连蛋白结构域的蛋白质，参与细胞粘附、肌肉再生、肿瘤转移等生物学过程。

• 产品形式：冻干粉，通常提供15 nmol或30 nmol规格，分装为多管形式以确保高效基因敲低1。

• 化学修饰：部分产品可能含2'-O-甲基（2'-OMe）修饰，增强稳定性并提高体内/体外敲低效率1。

• 保存条件：-20℃避光保存，避免反复冻融，可稳定储存一年1。

2. 设计原则与验证

设计关键点

• 靶点选择：优先选择编码区（CDS）内高度保守且与非目标基因低同源的序列，避免5'UTR/3'UTR区域（因调控蛋白结合可能影响效果）234。

• GC含量：推荐30%-55%，过高或过低均可能降低双链稳定性45。

• 脱靶效应控制：

• 使用生物信息学工具（如BLAST、siRNAScan）排除与非靶基因的高同源性区域26。

• 设计多条序列（如3条）混合使用（SMARTpool策略），减少脱靶风险17。

• 序列修饰：部分产品含3'端dTdT修饰，增强双链稳定性4。

验证方法

• mRNA水平：转染后48小时通过qPCR检测FNDC1表达下降8。

• 蛋白水平：转染后72小时通过Western blot验证蛋白敲低效果8。

• 功能验证：结合细胞增殖、迁移等表型实验（如CCK-8、Transwell）评估FNDC1功能910。

3. 应用背景

FNDC1在多种生理病理过程中发挥重要作用，其siRNA可应用于以下研究：

1. 肿瘤研究：抑制胃癌细胞增殖与转移，探索其调控信号通路（如MAPK、PI3K/AKT）911。

2. 肌肉再生：研究FNDC1在骨骼肌损伤修复中的作用，如促进成肌细胞分化10。

3. 心血管疾病：探索FNDC1与动脉粥样硬化、心肌纤维化的关系11。

4. 免疫调控：分析其在炎症反应或免疫细胞功能中的潜在角色11。

4. 实验操作要点

转染步骤

• 细胞准备：选择高转染效率的细胞系（如HEK293、Hela），转染前细胞密度控制在70%-90%512。

• 转染试剂：常用Lipofectamine RNAiMAX、Lipo8000或Entranster，按推荐比例混合siRNA与试剂5812。

• 转染浓度：通常50-100 nM，需通过预实验优化12。

关键注意事项

• 脱靶效应检测：

• 使用全基因组测序或脱靶预测工具（如dsCheck）筛选非靶基因表达变化67。

• 设置阴性对照（scramble siRNA）和阳性对照（如GAPDH siRNA）813。

• 时间窗口：蛋白水平检测需在转染后72小时，避免因半衰期差异导致假阴性8。

5. 替代方案与扩展应用

• shRNA载体：适用于长期基因沉默或体内研究，通过慢病毒或腺病毒递送1415。

• CRISPR/Cas9：若需永久敲除FNDC1，可结合siRNA进行功能互补实验1617。

总结

FNDC1 siRNA（Cat No.：CL-SP228）是研究该基因功能的高效工具，需结合严格的设计原则、转染优化及脱靶验证。建议参考供应商说明书并结合文献验证序列（如胃癌或肌肉再生模型）以提高实验可靠性91011。